研究报告

西瓜 TPS 家族基因的鉴定、分类与分析  

孙梦利1 , 徐子健1 , 王世豪1 , 江雪飞1* , 孙化鹏 2 , 乔飞2
1 海南大学热带农林学院, 省部共建国家重点实验室培育基地, 海南省热带生物资源可持续利用重点实验室, 海口, 570228; 2 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 儋州, 571737
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2017年10月30日    接受日期: 2017年11月27日    发表日期: 2018年05月23日
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摘要

海藻糖 -6- 磷酸合成酶(TPS)是海藻糖合成过程的关键酶,与植物抗逆性密切相关。本研究利用西瓜基因组数据库,通过生物信息学对西瓜 TPS 家族基因进行鉴定分类,基因结构,染色体位置,蛋白结构域、系统进化、基因表达分析。研究结果表明:西瓜中 TPS 家族基因共有 7 个成员;7 TPS 基因分为 Class Class 两类,Class包含有 2 个基因(ClTPS2, ClTPS7),其余为 Class;染色体定位分析发现,西瓜 TPS 家族基因成员均单个分布在 7 条染色体上;蛋白结构域分析显示,西瓜中 TPS 家族基因具有典型的 TPS 结构域和 TPP 结构域;系统进化显示,TPS 家族蛋白分为四个类群,西瓜 TPS 蛋白在三个类群中都有分布,暗示了西瓜 TPS 蛋白家族成员起源的多样性;表达分析显示,西瓜 TPS 家族基因对渗透胁迫有不同程度的应答模式。这些研究结果为进一步解析西瓜 TPS 家族基因的生物学功能以及利用基因工程提高西瓜抗逆性提供了理论指导。

关键词
西瓜;TPS 家族基因;全基因组鉴定;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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